Τα όργανα διοίκησης  κάθε σχολείου πρωτοβάθμιας  και δευτεροβάθμιας εκπαίδευσης είναι ο διευθυντής, ο υποδιευθυντής και ο σύλλογος διδασκόντων.

Σημαντικό ρόλο επίσης στην λειτουργία κάθε σχολικής μονάδας έχει και η σχολική επιτροπή που συνδέει το σχολείο με την τοπική αυτοδιοίκηση. Μέσω της  μέσω της σχολική επιτροπής το σχολείο λαμβάνει τα απαραίτητα για την λειτουργία του οικονομικά κονδύλια.